계약직, 프리랜서, 사업자중에 어떤것이 유리할까요?

안녕하세요.. 매일 읽기만 하다가 위 사항이 궁금해서 질문드립니다. 1. 계약직 직원으로 근로소득세를 납부하고 연말정산(혹은 다음해 종합소득세 정산) 하는것과, 2. 프리랜서로 계약해서 3.3% 원천징수후 다음해 종합소득세 정산, 3. 사업자등록후 부가세포함 990만원 수령(세금 계산서 발행) 다음해 종합소득세 정산하는것, 단가가 월 900만원 정도이고, 위 3가지 모두 계약직 직원으로 근무하는것과 동일한 조건(Full Time근무, 개인이 부담하는 비용은 전혀 없음)일때, 위 3가지중에 어떤것이 가장 유리할까요..? 저는 40대 중반으로 30대때는 1.조건으로 여러 회사에서 근무하고, 40대때는 2. 조건으로 여러 프로젝트를 진행해 왔습니다. 아직은 단가 900이 아니지만, 내년이나 내후년에는 이 단가를 희망하면서 현재 프리랜서와 사업자 등록중에 어떤것이 좋을지 고민하고 있습니다. 제 생각에는 1년에 공실이 4개월 이상되면 2.조건이 유리한것 같은데, 공실이 2개월 미만일 경우는 어떻게 될지 아직 경험이 없어서 따져보기 힘든것 같습니다.